Das Tao des Lebens

Zeitzyklen aus Licht und Dunkelheit als kategorisches Ordnungsmuster für die ersten Lebensmoleküle.

Roland Frey

• Verlag: tredition
• Jahr: 2016
• ISBN:
  9783734554391
• Thema: Biological Sciences
• Thema: Science General

Das Buch beschreibt eine Hypothese zur Entstehung des Lebens auf der Erde. Sie geht davon aus, daß die mikrokosmische molekulare Basis des Lebens durch Anpassung an die makrokosmischen astronomischen Rhythmen entstand, welche auf die Erde einwirken. Von der Erde aus gesehen, erscheinen diese Rhythmen als "Lauf" der Sonne, des Mondes und des Sternenhimmels. Sie erzeugen die Zeitzyklen des 24h-Tages, des Monats und des Jahres und werden durch einen vierten Rhythmus, den 19 Jahre dauernden Lunisolarzyklus (Meton-Zyklus) zu einem "gemeinsamen Rhythmuskreis" vereint. Die Grundstruktur des chinesischen Buchs der Wandlungen (I Ging) beruht ebenfalls auf den makrokosmischen astronomischen Rhythmen, welche auf die Erde einwirken. Diese Rhythmen und die daraus resultierende "zyklische Zeit" der Erde wurden von frühen Chinesen beobachtet und dazu verwendet, das Buch der Wandlungen als ein symbolisches mikrokosmisches Modell der makrokosmischen Rhythmen zu konstruieren. Daher sind die molekulare Basis des Lebens und die Grundstruktur des I Ging einander ähnlich. Nach dem hier vorgestellten Ansatz ist die Basis des Lebens ein mikrokosmisches "Abbild" der makrokosmischen Rhythmen. Dies liefert eine einfache Erklärung für die Einheit von Makro- und Mikrokosmos in dem Sinne, daß der Mikrokosmos das makrokosmische Ordnungsmuster in sich trägt.

Literatur

Ahmad M, Cashmore AR (1993) HY4 gene of A. thaliana encodes a protein with characteristics of a blue-light photoreceptor. Nature 366, 162-166.

Alabert C, Groth A (2012) Chromatin replication and epigenome maintenance. Nature Reviews, Molecular cell biology 13, 153-167.

Alexeyev M, Shokolenko I, Wilson G, LeDoux S (2013) The maintenance of mitochondrial DNA integrity - critical analysis and update. Cold Spring Harb Perspect Biol 2013; 5:a012641, 1-17.

Allentoft ME, Collins M, Harker D, Haile J, Oskam CL, Hale ML, Campos PF, Samaniego JA, Gilbert

MTP, Willerslev E, Zhang G, Scofield RP, Holdaway RN, Bunce M (2012) The half-life of DNA in bone: measuring decay kinetics in 158 dated fossils. Proc R Soc B 279, 4724-4733.

Allers T, Mevarech M (2005) Archaeal genetics - the third way. Nature Rev Genet 6, 58-73.

Altaf M, Saksouk N, Côté J (2007) Histone modifications in response to DNA damage. Mut Res 618, 81-90.

Altman-Price N, Mevarech M (2009) Genetic evidence for the importance of protein acetylation and protein deacetylation in the halophilic archaeon Haloferax volcanii. J Bacteriol 191, 16101617.

Ammar R, Torti D, Tsui K, Gebbia M, Durbic T, Baderf GD, Giaever G, Nislow C (2012) Chromatin is an ancient innovation conserved between Archaea and Eukarya. eLife 2012; 1: e000078.

Anderson DM, Keafer BA (1987) An endogenous annual clock in the toxic marine dinoflagellate Gonyaulax tamarensis. Nature 325, 616-617.

Aravind L, Walker DR, Koonin EV (1999) Conserved domains in DNA repair proteins and evolution of repair systems. Nucleic Acids Res 27, 1223-1242.

Arbab AI (2009) The length of the day: a cosmological perspective. Prog Phys 1, 8-11.

Arena S (2013) Lighting for digital photography. From snapshots to great shots. San Francisco, Peachpit Press, 277 pp.

Arents G, Burlingame RW, Wang B-C, Love WE (1991) The nucleosomal core histone octamer at 3.1 Å resolution: a tripartite protein assembly and a left-handed superhelix. Proc Natl Acad Sci USA 88, 10148-10152.

Arents G, Moudrianakis EN (1995) The histone fold: a ubiquitous architectural motif utilized in DNA compaction and protein dimerization. Proc. Natl Acad Sci USA 92, 11170-1174.

Ayrapetov MK, Gursoy-Yuzugullu O, Xu C, Xu Y, Price BD (2014) DNA double-strand breaks promote methylation of histone H3 on lysine 9 and transient formation of repressive chromatin. PNAS 111, 9169-9174.

Babcock RC, Bull GD, Harrison PL, Heyward AJ, Oliver JK, Wallace CC, Willis BL (1986) Synchronous spawnings of 105 scleractinian coral species on the Great Barrier Reef. Mar Biol 90, 379-394.

Bailey KA, Chow CS, Reeve JN (1999) Histone stoichiometry and DNA circularization in archaeal nucleosomes. Nucl Acids Res 27, 532-536.

Bailey KA, Marc F, Sandman K, Reeve JN (2002) Both DNA and histone fold sequences contribute to archaeal nucleosome stability. J Biol Chem 277, 9293-9301.

Bailey KA, Pereira SL, Widom J, Reeve JN (2000) Archaeal histone selection of nucleosome positioning sequences and the procaryotic origin of histone-dependent genome evolution. J Mol Biol 303, 25-34.

Bailey KA, Reeve JN (1999) DNA repeats and archaeal nucleosome positioning. Res Microbiol 150, 701-709.

Banerjee R, Batschauer A (2005) Plant blue-light receptors. Planta 220, 498-502.

Barry ER, Bell SD (2006) DNA replication in the archaea. Microbiol Mol Biol Rev 70, 876-887.

Batschauer A (2005) Plant cryptochromes: their genes, biochemistry, and physiological roles, 2112-2146. In Briggs WR, Sudich JL (eds) Handbook of photosensory receptors. Weinheim, Wiley-VCH.

Baylor ER, Smith FE (1957) Diurnal migration of Plankton crustaceans, 21-35. In: Scheer BT (ed) Recent advances in invertebrate physiology – a symposium. University of Oregon Publications. Eugene, Oregon. 304 pp.

Benoit-Bird KJ, Au WWL, Wisdom DW (2009) Nocturnal light and lunar cycle effects on diel migration of micronekton. Limnol Oceanography 54, 1789-1800.

Bentley MG, Olive PJW, Last K (2001) Sexual satellites, moonlight and the nuptial dances of worms: the influence of the moon on the reproduction of marine animals. Earth, Moon and Planets 85-86, 67-84.

Benvenuto G, Formiggini F, Laflamme P, Malakhov M, Bowler C (2002) The photomorphogenesis regulator DET 1 binds to the amino-terminal tail of histone H2B in a nucleosome context. Curr Biol 12, 1529-1534.

Berger S (2002) Histone modifications in transcriptional regulation. Curr Opin Genet Dev 12, 142-148.

Berry WBN, Barker RM (1968) Fossil bivalve shells indicate longer month and year in Cretaceous than present. Nature 217, 938-939.

Bieler J, Cannavo R, Gustafson K, Gobet C, Gatfield D (2014) Robust synchronization of coupled circadian and cell cycle oscillators in single mammalian cells. Mol Syst Biol 10, 739, 1-17.

Bijma J, Erez J, Hemleben C (1990) Lunar and semi-lunar reproductive cycles in some spinose planktonic foraminifers. J Foramin Res 20, 117-127.

Bina-Stein M, Simpson RT (1977) Specific folding and contraction of DNA by histones H3 and H4. Cell 11, 609-618.

Blankenship RE (2002) Molecular mechanisms of photosynthesis. Oxford, London, Edinburgh: Blackwell, 321 pp.

Boesch P, Weber-Lotfi F, Ibrahim N, Tarasenko V, Cosset A, Paulus F, Lightowlers RN, Dietrich A (2011) DNA repair in organelles: pathways, organization, regulation, relevance in disease and aging. Biochim Biophys Acta 1813, 186-200.

Bönisch C, Hake SB (2012) Histone H2A variants in nucleosomes and chromatin: more or less stable? Nucleic Acids Research 2012, 1-23.

Bonner J (1959) The photoperiodic process. In: Withrow RB (ed) Photoperiodism and related phenomena in plants and animals. American Association for the advancement of Science, Washington D.C., Publication No 55: 245-254.

Bonner J, Dahmus ME, Fambrough D, Huang RC, Marushige K, Tuan DYH (1968) The biology of isolated chromatin. Chromosomes, biologically active in the test tube, provide a powerful tool for the study of gene action. Science 159, 47-56.

Bonner J, Huang RC (1963) Properties of chromosomal nucleohistone. J Mol Biol 6, 169-174. Borchert R, Renner SS, Calle Z, Navarrete D, Tye A, Gautier L, Spichiger R, Hildebrand Pv (2005) Photoperiodic induction of synchronous flowering near the equator. Nature 433, 627-629.

Bouget F-Y, Moulager M, Corellou F (2007) Circadian regulation of cell division, 3-12. In Verma DPS, Hong Z (eds) Cell division control in plants. Plant cell Monogr (9). Berlin, Heidelberg, Springer, 417pp.

Briggs WR (2007) The LOV domain: a chromophore module servicing multiple photoreceptors. J Biomed Sci 14, 499-504.

Briggs WR, Olney MA (2001) Photoreceptors in plant morphogenesis to date. Five phytochromes, two cryptochromes, one phototropin, and one superchrome. Plant Physiol 125, 85-88. Brosche P, Sündermann J (eds) (1978) Tidal friction and the earth’s rotation I. Berlin, Heidelberg, New York, Springer, 243 pp.

Brown FA (1957) The Rhythmic nature of life, 287-304. In: Scheer BT (ed) Recent advances in invertebrate physiology – a symposium. University of Oregon Publications. Eugene, Oregon. 304 pp.

Brown FA, Bennett MF, Webb HM, Ralph CL (1958) Monthly cycles in an organism in constant conditions during 1956 and 1957. Biochem 44, 290-296.

Brown FA, Fingerman M, Sandeen MI, Webb HM (1953) Persistent diurnal and tidal rhythms of color change in the fiddler crab, Uca pugnax. J Exp Zool 123, 29-60.

Brown FA, Webb HM, Bennett MF (1955) Proof for an endogenous component in persistent solar and lunar rhythmicity in organisms. Proc Nat Acad Sci Washington 41, 93-100.

Browning DF, Grainger DC, Busby SJW (2010) Effects of nucleoid-associated proteins on bacterial chromosome structure and gene expression. Curr Opin Microbiol 13, 773-780.

Broyles SS, Pettijohn DE (1986) Interaction of the Escherichia coli HU protein with DNA. Evidence for formation of nucleosome-like structures with altered DNA helical pitch. J Mol Biol 187, 47-60.

Budki P, Rani S, Kumar V (2012) Persistence of circannual rhythms under constant periodic and aperiodic light conditions: sex differeneces and relationship with the external environment. J Exp Biol 215, 3774-3785.

Bünning E (1949) Zur Physiologie der endogenen Jahresrhythmik in Pflanzen, speziell in Samen. Z Naturforschg 4b, 167-176.

Bünning E (1956) Endogenous rhythms in plants. Annu Rev Plant Physiol 7, 71-90.

Bünning E (1963) Die physiologische Uhr. Zeitmessung in Organismen mit ungefähr tagesperiodischen Schwingungen. 2. Auflage. Berlin, Göttingen, Heidelberg, Springer Verlag, 153 pp.

Bünning E (1973) The physiological clock. Circadian rhythms and biological chronometry. Heidelberg Science Library, revised 3rd edition, Springer Verlag, New York, 258 pp.

Bünning E (1977) Die physiologiche Uhr. Circadiane Rhythmik und Biochronometrie. Dritte, gründlich überarbeitete Auflage. Springer Verlag, Berlin, Heidelberg, New York, 176 pp.

Bünning E, Müller D (1961) Wie messen Organismen lunare Zyklen? Z Naturforschg 16b, 391-395. Buma J, Erez J, Hemleben C (1990) Lunar and semi-lunar reproductive cycles in some spinose planktonic foraminiferes. J Foraminif Res 20, 117-127.

Burgess RJ, Zhang Z (2013) Histone chaperones in nucleosome assembly and human disease. Nat Struct Mol Biol 20, 14-22.

Butler WB, Mueller GC (1973) Control of histone synthesis in HeLa cells. Biochim Biophys Acta 294, 481-496.

Cadée N, Piersma T, Daan S (1996) Endogenous circannual rhythmicity in a non-passerine migrant, the knot Calidris canutus. Ardea 84, 75-84.

Cairns BR (2009) The logic of chromatin architecture and remodelling at promoters. Nature 461, 193-198.

Cannavo R, Bieler J, Gustafson K, Gobet C, Gatfield D, Naef F (2014) Synchronization of circadian and cell cycle oscillators. Poster 144. 2nd Int SystemsX.ch conference on systems biology, October 20-23, Lausanne, Switzerland.

Cardone L, Sassone-Corsi P (2003) Timing the cell cycle. Nat Cell Biol 5, 859-861.

Carré IA, Edmunds LN (1993) Oscillator control of cell division in Euglena: cyclic AMP oscillations mediate the phasing of the cell division cycle by the circadian clock. J Cell Sci 104, 1163-1173.

Cashmore AR, Jarillo JA, Wu Y-J, Liu D (1999) Cryptochromes: blue light receptors for plants and animals. Science 284, 760-765.

Caspers H (1951) Rhythmische Erscheinungen in der Fortpflanzung von Clunio marinus (Dipt., Chiron.) und das Problem der lunaren Periodizität bei Organismen. Arch Hydrobiol 18, 415-594.

Caspers H (1984) Spawning periodicity and habitat of the palolo worm Eunice viridi...

Inhaltsverzeichnis

• Cover
• Titel
• Impressum
• Untertitel, Widmung, Motto
• Erläuternde Einleitung
• Zyklen aus Licht und Dunkelheit bei Pflanzen
• Zyklische molekulare Zeitmessung
• DNA-bindende Proteine, Histone und DNA
• Der Zusammenhang mit dem zyklischen Mondwandel
• Ein primordialer molekularer Protein/Nukleinsäure-Oszillator an der Basis des Lebens
• Drei Evolutionsstufen der primordialen Lebensmolekel – die “Vollendung im Kleinen”
• Die Eroberung der solaren Starklichtphase des 24h-Tages
• Die Ähnlichkeit der drei Evolutionsstufen der primordialen Lebensmolekel mit der Grundstruktur des chinesischen Buchs der Wandlungen (I Ging)
• Die grundlegende Komplementarität
• Der Zyklus aus vier Komponenten
• Der Zyklus aus acht Komponenten
• Die Stufe der 64 Hexagramme bzw. die Stufe der „10.000 Dinge“ oder der Diversität
• Schlußfolgerung
• Danksagung
• Literatur